La réalisation du SCOT s'organise autour d'ateliers thématiques et d'études qui sont autant de lieux de débat sur l'avenir du territoire.

Ils sont composés d'élus représentants les communes et les intercommunalités membres du Syndicat ainsi que des représentants des "personnes associées", notamment l'Etat, la Région, le Département et les chambres consulaires.
Les travaux de ces instances permettront de formuler les orientations sur l'aménagement du territoire qui donneront au SCOT ses lignes directrices.

Plusieurs ateliers thématiques seront créés comme par exemple : environnement, habitat et vie sociale, développement économique, aménagement de l'espace et grands équipements, déplacements…